La Administración del Puerto de Sines (APS) fue creada en el 14 de diciembre de 1977, por el Decreto-Ley Nº 508/77, teniendo como responsabilidad la gestión e explotación del Puerto de Sines, cuya construcción se había iniciado en 1973.
APS fue creada como instituto público, dotado de personalidad jurídica y autonomía administrativa y financiera. Su incumbencia era entonces, la gestión y explotación de la única terminal existente – la Terminal Petrolera (actual Terminal de Gráneles Líquidos).
Entre as sus competencias, cabe a la empresa explotar económicamente, conservar, e desarrollar el puerto de Sines; elaborar los estudios y planes de obras marítimas y terrestres e del equipamiento del puerto a someter a la aprobación del Gobierno; construir, adquirir, conservar y fiscalizar las obras marítimas y terrestres y el equipamiento flotante y terrestre del puerto, teniendo aún por misión asegurar la coordinación, fiscalizar y reglamentar las actividades ejercidas dentro da su área de jurisdicción, sin prejuicio de las atribuciones conferidas por ley a otras entidades.
En 1998, a par de las otras cuatro principales administraciones portuarias del país (Lisboa, Setúbal, Leixões e Aveiro), la Administración del Puerto de Sines fue transformada en una sociedad anónima de capitales públicos, particularmente estructurada para otorgar concesiones a operadores privados, por el Decreto-Ley Nº 337/98. Es de esta forma creada APS,SA.
En marzo del 2014, el Decreto-Ley Nº 44/2014 establece el régimen de transferencia de los puertos comerciales de Faro y Portimão para APS, S.A. Nace APS – Administração dos Portos de Sines e do Algarve, SA, a quien es atribuida la jurisdicción portuaria directa en las zonas marítimas, fluviales-marítimas y terrestres necesarias a la explotación portuaria de los puertos comerciales de Faro y Portimão, anteriormente atribuida al IPTM, I.P., lo que implica no solo la transferencia de las funciones jurisdiccionales relativas a los dos puertos comerciales, pero también del patrimonio, personal y recursos financieros que le están relacionados.