Desde el inicio de su historia, APS siempre estuvo dotada de instrumentos de gestión estratégica de medio y largo plazo, con el objetivo de usarlos como líneas orientadoras de su actividad y investimentos de esta administración, basados en presupuestos de eficacia, racionalidad y competitividad, no solo al nivel del relacionamiento con su envolvente, como también al nivel de su procesos internos y modelo de gestión a seguir.
El último Plan Estratégico elaborado contuvo la visión de posicionar el Puerto de Sines entre los puertos de referencia en Europa y como motor de transformación de la región donde se insiere, considerando cinco objetivos estratégicos:
1. Consolidación del Modelo de Gestión como LandLord Port
2. Incremento de la Movimientación de mercancías en 102% hasta 2015
3. Afirmación del Puerto de Sines como motor de la actividad económica regional y nacional
4. Desarrollar la Info-estructura portuaria
5. Aumentar la seguridad marítima y portuaria
El esfuerzo conjunto de la Administración Portuaria y toda la Comunidad Portuaria para el cumplimiento de estos objetivos, ha permitido obtener resultados muy satisfactorios, como puede comprobarse en el grafico siguiente.

Actualmente, la formulación de una nueva visión integrada e económica de los tres puertos que se encuentran bajo la gestión de APS, soportada en una correcta comprensión de las actuales dinámicas de evolución del sector marítimo e portuario, bien como de articulación al nivel de la gestión del territorio, intermodalidad e gestión de los recursos disponibles, aportan nuevos desafíos estratégicos que importa destacar.